تظهر أعراض الطاعون الدبلي عادة بعد 2 إلى 5 أيام من التعرض للبكتيريا ، ولكن يمكن أن تحدث من بضع ساعات إلى 12 يوما في وقت لاحق. تبدأ فجأة مع قشعريرة وحمى تصل إلى 41 درجة مئوية. نبضات تصبح سريعة وضعيفة ويمكن أن ينخفض ضغط الدم. يظهر الشرج في نفس الوقت أو بعد فترة وجيزة من الحمى وعادة ما يكون مؤلمًا للجس.
يمكن أن يكون الطاعون الناجم عن عدوى يرسينيا بيستيس هو التسمم الدموي ، أو الالتهاب الرئوي ، أو إنتان الدموي أو الطاعون البسيط ، وتختلف الأعراض باختلاف نوع الطاعون. قد يكون هناك أرق ، وهذيان ، وارتباك عقلي ، وفقدان التنسيق الحركي. قد يزيد الكبد والطحال من حيث الحجم.
يموت أكثر من نصف الأفراد غير المعالجين بين اليوم الثالث والخامس بعد ظهور الأعراض.